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Petites molécules
Macromolécules
Crystallographie
Orbitales
Réactions, vibrations, etc.

Petites molécules

Jmol screenshot Acide acétique utilisant les couleurs CPK et des atoms remplis.
Jmol screenshot Un rendu avec ombre de la caféine, avec quelques mesures affichées (distance, angle, dihèdre).
Jmol screenshot Affichage de la boîte englobante et des axes du système de coordonnées. Il faut noter la transparence du halo jaune autour des atomes sélectionnés.
Jmol screenshot Le potentiel électrostatique de l'allene mappé sur une surface translucide. (contribution de Nick Greeves)
Jmol screenshot Deux plans translucides (pMesh) illustrant les plans de symétrie pour une molécule d'eau. (contribution de Bob Hanson)

Macromolécules

Jmol screenshot A few residues with backbone in blue and vdw dots surface.
Jmol screenshot Hemoglobin with backbone trace colored by chain and spacefilled hemes.
Jmol screenshot Crystal structure of an H/ACA box RNP from Pyrococcus furiosus (PDB CODE: 2HVY)
Cbf5p    Gar1    Nop10    L7AE    RNA
A nucleotide of the RNA helix is flipped out into the active site formed by the protein complex.
(contribution Wayne Decatur)
Jmol screenshot Biotin (cpk color, spacefilled) inside its binding pocket in a streptavidin subunit (cyan translucent surface) and capped by a portion of the neighbour streptavidin subunit (yellow translucent surface).
(contribution de Angel Herráez)
Jmol screenshot A fragment of transcription factor TFIIIA forming three consecutive zinc finger motifs (cartoons), bound to a stretch of DNA (spacefilled). (contribution de Angel Herráez)
Jmol screenshot Highlighting two salt bridges in hemoglobin tetramer (hemo group as sticks at bottom-right). (contribution de Angel Herráez)
Jmol screenshot Eubacterial 70S Ribosome from Thermus thermophilus (PDB CODES: 1jgo and 1giy)
On the right is the small subunit and on the left is the large subunit.
In between the subunits: mRNA A-site tRNA P-site tRNA E-site tRNA (contribution de Wayne Decatur)

Crystallographie

Jmol screenshot Affichage d'une structure de crystal de quartz, remplissant 2x2x2 cellules unitaires. La boîte englobante de la cellule unitaire est dessinée et les données de la cellule unitaire sont montrés en haut à gauche. (contribution de Bob Hanson)
Jmol screenshot Réseau de tétrahèdres de silicate d'aluminium et le volume disponible pour absorbtion. (contribution de Alan Hewat)

Orbitales

Jmol screenshot The 4f-orbitals (contribution de Nick Greeves)
Jmol screenshot Cartoon p-orbitals of benzene together with the corresponding translucent molecular orbital. (contribution de Nick Greeves)

Réactions, vibrations, etc.

Jmol screenshot Animation d'une réaction SN2 avec la distance mesurée entre les atomes de chlore et de carbone.
Jmol screenshot Animation de la vibration du benzène avec les vecteurs affichés sous la forme de flèches jaunes et une liste de fréquences de vibration.
Jmol screenshot Table périodique des éléments affichant les rayons atomiques, de van der Waals et ioniques pour tous les éléments avec leur couleur unique. (contribution de Angel Herráez)


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