Documentación de Jmol

Bibliografía de Jmol

Se puede encontrar una lista de publicaciones que describen Jmol en la Wiki de Jmol.

Notas técnicas de Jmol

Este documento proporciona información técnica sobre cómo está construido Jmol, en particular en lo relativo al trazado de gráficos.

Guiones para Jmol

Documentación de guiones

Esta documentación interactiva en línea (en inglés) es la guía de referencia para todas las instrucciones que forman el lenguaje de guiones para Jmol. Además de una descripción exhaustiva de todas las instrucciones y sus opciones, proporciona excelentes demostraciones y ejemplos.

Documentación de la biblioteca javascript

Jmol.js (incluida en la distribución estándar de Jmol) es una biblioteca javascript que puede usarse para simplificar el desarrollo de páginas web que incluyan la miniaplicación JmolApplet. Aquí está su descripción y documentación.

Guiones para JmolApplet sin usar la biblioteca javascript

Este documento explica cómo escribir guiones para interaccionar con la miniaplicación. Ten en cuenta que estos métodos no utilizan la biblioteca javascript, que es el método actualmente recomendado para comenzar a escribir guiones para Jmol.

Documentación de superficies

Esta documentación (en inglés) describe y compara las diversas opciones disponibles en Jmol (v.11) para la generación de superficies, bien basadas en la molécula o bien geométricas. También proporciona una página de pruebas y demostración.

Colores usados por Jmol

Este documento especifica qué colores usa Jmol para los elementos, estructura secundaria, residuos, cadenas, carga, enlaces de hidrógeno, orientación en la cadena e isosuperficies. También indica los nombres de colores reconocidos por javascript y la paleta de colores de 8 bits de Netscape.

Radios atómicos e iónicos usados por Jmol

Este documento demuestra, usando una tabla periódica tridimensional, los radios que usa Jmol para los elementos. Incluye radios atómicos, de van der Waals e iónicos.

Guía para desarrolladores de Jmol

Describe los procedimientos de desarrollo de Jmol; Jmol Developers Guide.

Documentación oficial pero no actualizada

Éstas son las guías oficiales de Jmol. Cubren la funcionalidad básica de la aplicación y la miniaplicación, pero no se han actualizado recientemente (en particular, en las prestaciones de la versión 11 de Jmol).

Guía de Jmol

Describe la aplicación -o programa autónomo- Jmol; Jmol Guide.

Guía de la miniaplicación Jmol

Describe la miniaplicación Jmol; Jmol Applet Guide.

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