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Documentación de Jmol

Bibliografía de Jmol
Notas técnicas de Jmol
Traducción de Jmol
Guiones para Jmol
     Documentación de guiones
     Documentación de la biblioteca javascript
     Guiones para JmolApplet sin usar la biblioteca javascript
     Documentación de superficies
Colores usados por Jmol
Radios atómicos e iónicos usados por Jmol
Guía para desarrolladores de Jmol
Documentación oficial pero no actualizada
     Guía de Jmol
     Guía de la miniaplicación Jmol

Bibliografía de Jmol

Se puede encontrar una lista de publicaciones que describen Jmol en la Wiki de Jmol.

Notas técnicas de Jmol

Este documento proporciona información técnica sobre cómo está construido Jmol, en particular en lo relativo al trazado de gráficos.

Traducción de Jmol

Jmol se puede traducir a tu idioma. Lee las instrucciones en esta página Wiki y, si necesitas ayuda, contacta con el equipo de desarrollo.

Guiones para Jmol

Documentación de guiones

Esta documentación interactiva en línea (en inglés) es la guía de referencia para todas las instrucciones que forman el lenguaje de guiones para Jmol. Además de una descripción exhaustiva de todas las instrucciones y sus opciones, proporciona excelentes demostraciones y ejemplos.

Documentación de la biblioteca javascript

Jmol.js (incluida en la distribución estándar de Jmol) es una biblioteca, escrita en javascript, que puede usarse para simplificar el desarrollo de páginas web que incluyan la miniaplicación JmolApplet. Aquí está su descripción y documentación.

Guiones para JmolApplet sin usar la biblioteca javascript

Ten en cuenta que no es recomendable utilizar estos métodos. Sólo debes usarlos si tienes experiencia y sabes exactamente lo que necesitas. En especial, si estás aprendiendo a usar la miniaplicación Jmol y a escribir guiones para ella, deberías usar sólo la biblioteca javascript.

No insertes la miniaplicación Jmol usando la etiqueta <applet>. Con los navegadores antiguos era posible poner una etiqueta <applet> en una página y así crear una miniaplicación Jmol. Con los navegadores más modernos, y en particular los que implementan HTML5, la etiqueta <applet> es obsoleta y no debe usarse. En su lugar, utiliza la etiqueta <object>.

Documentación de superficies

Esta documentación (en inglés) describe y compara las diversas opciones disponibles en Jmol (v.11) para la generación de superficies, bien basadas en la molécula o bien geométricas. También proporciona una página de pruebas y demostración.

Colores usados por Jmol

Este documento especifica qué colores usa Jmol para los elementos, estructura secundaria, residuos, cadenas, carga, enlaces de hidrógeno, orientación en la cadena e isosuperficies. También indica los nombres de colores reconocidos por javascript y la paleta de colores de 8 bits de Netscape.

Radios atómicos e iónicos usados por Jmol

Este documento demuestra, usando una tabla periódica tridimensional, los radios que usa Jmol para los elementos. Incluye radios atómicos, de van der Waals e iónicos.

Guía para desarrolladores de Jmol

Describe los procedimientos de desarrollo de Jmol; Jmol Developers Guide.

Documentación oficial pero no actualizada

Éstas son las guías oficiales de Jmol. Cubren la funcionalidad básica de la aplicación y la miniaplicación, pero no se han actualizado recientemente (en particular, en las prestaciones de la versión 11 de Jmol).

Guía de Jmol

Describe la aplicación -o programa autónomo- Jmol; Jmol Guide.

Guía de la miniaplicación Jmol

Describe la miniaplicación Jmol; Jmol Applet Guide.



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